Всегда пишется раздельно, и в составе устойчивого выражения «быть в курсе» и в качестве существительного с предлогом.
Примеры:
Быть в курсе нововведений.
В курсе доллара наблюдались сильные скачки.
В курсе корабля изменений не было: он по-прежнему двигался на север.