Чаще всего пишется через дефис.
В кабинете сидела женщина-врач.
Правило
§93.2. Примечание 1. Одиночное приложение обычно присоединяется к определяемому нарицательному существительному посредством дефиса.
Но в некоторых случаях возможно написание и через запятую.
Правило
§93.2. Примечание 2. В некоторых случаях возможно дефисное написание и при наличии пояснительного слова (определения), которое по смыслу может относиться… или только к приложению (женщина-врач с большим стажем). Однако в этих случаях возможна двоякая пунктуация.
Сравните:
Она — женщина-врач с большим стажем. Она — женщина, врач с большим стажем.
